NVIDIA BioNeMo permite IA generativa para descoberta de medicamentos no AWS

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Os pesquisadores e desenvolvedores das principais empresas farmacêuticas e de tecnologia podem agora implementar facilmente o software e os serviços NVIDIA Clara para acelerar os cuidados com a saúde por meio do Amazon Web Services.

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A iniciativa oferece aos desenvolvedores de saúde e ciências da vida, que usam os recursos de nuvem do AWS, a flexibilidade para integrar ofertas aceleradas pela NVIDIA, como o NVIDIA BioNeMo – uma plataforma de IA generativa para descoberta de medicamentos – que está chegando ao NVIDIA DGX Cloud no AWS e atualmente está disponível por meio da ferramenta de gerenciamento de cluster AWS ParallelCluster para computação de alto desempenho e o serviço de aprendizado de máquina Amazon SageMaker.

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Milhares de empresas do setor de saúde e ciências biológicas em todo o mundo usam a AWS. Agora, elas poderão acessar o BioNeMo para criar ou personalizar modelos de base de biologia digital com dados proprietários, ampliando o treinamento e a implantação do modelo usando servidores em nuvem acelerados por GPU da NVIDIA em nuvem no AWS.

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Os inovadores da Techbio, incluindo Alchemab Therapeutics, Basecamp Research, Character Biosciences, Etcembly e LabGenius estão entre os usuários da AWS que já estão usando o BioNeMo para descoberta e desenvolvimento de medicamentos acelerados por IA generativa. Essa colaboração oferece a eles mais maneiras de ampliar rapidamente os recursos de computação em nuvem para desenvolver modelos de IA generativa treinados em dados biomoleculares.

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Esse anúncio amplia as ofertas existentes da NVIDIA voltadas para o setor de saúde disponíveis no AWS – NVIDIA MONAI para fluxos de trabalho de imagens médicas e NVIDIA Parabricks para genômica acelerada.

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“Essa iniciativa possibilitará flexibilidade e otimização ao trabalho dos desenvolvedores na busca por novos medicamentos e melhorias na detecção de imagens médicas. A colaboração terá um impacto positivo no setor da saúde”, afirma Marcio Aguiar, diretor da divisão Enterprise da NVIDIA para América Latina.

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Novo no AWS: NVIDIA BioNeMo avança a IA generativa para a descoberta de medicamentos

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O BioNeMo é uma estrutura específica de domínio para IA generativa de biologia digital, incluindo modelos de linguagem grande (LLMs) pré-treinados, carregadores de dados e receitas de treinamento otimizadas que podem ajudar no avanço da descoberta de medicamentos assistida por computador, acelerando a identificação de alvos, a previsão de estrutura de proteínas e triagem de candidatos a medicamentos.

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As equipes de descoberta de medicamentos podem usar seus dados proprietários para criar ou otimizar modelos com o BioNeMo e executá-los em clusters de computação de alto desempenho baseados em nuvem.

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Um desses modelos, o ESM-2 – um LLM avançado que oferece suporte à previsão de estruturas de proteínas – alcança um escalonamento quase linear em 256 GPUs NVIDIA H100 Tensor Core. Os pesquisadores podem escalonar para 512 GPUs H100 para concluir o treinamento em alguns dias em vez de um mês, o tempo de treinamento publicado no artigo original.

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Os desenvolvedores podem treinar o ESM-2 em escala usando pontos de verificação de 650 milhões ou 3 bilhões de parâmetros. Outros modelos de IA compatíveis com a estrutura de treinamento do BioNeMo incluem modelo gerador de moléculas MegaMolBART e modelo de geração de sequência de proteínas ProT5.

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Os modelos pré-treinados e as receitas de treinamento otimizadas do BioNeMo – que estão disponíveis usando serviços autogerenciados, como o AWS ParallelCluster e o Amazon ECS, bem como serviços integrados e gerenciados por meio do NVIDIA DGX Cloud e do Amazon SageMaker – podem ajudar as equipes de P&D a criar modelos básicos que podem explorar mais candidatos a medicamentos, otimizar a experimentação em laboratório úmido e encontrar candidatos clínicos promissores mais rapidamente.

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Também disponível no AWS: NVIDIA Clara para imagens médicas e genômica

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O Projeto MONAI, cofundado e apoiado pela NVIDIA para dar suporte a fluxos de trabalho de imagens médicas, foi baixado mais de 1,8 milhão de vezes e está disponível para implantação no AWS. Os desenvolvedores podem aproveitar seus conjuntos de dados de saúde proprietários já armazenados nos recursos de nuvem da AWS para anotar e criar rapidamente modelos de IA para imagens médicas.

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Esses modelos, treinados em instâncias do Amazon EC2 com GPU NVIDIA, podem ser usados para anotação interativa e ajuste fino para tarefas de segmentação, classificação, registro e detecção em imagens médicas. Os desenvolvedores também podem aproveitar os modelos de síntese de imagens de ressonância magnética disponíveis no MONAI para aumentar os conjuntos de dados de treinamento.

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Para acelerar os pipelines genômicos, o Parabricks permite a identificação de variantes em todo o genoma humano em cerca de 15 minutos, em comparação com um dia em um sistema de CPU. No AWS, os desenvolvedores podem aumentar rapidamente a escala para processar grandes quantidades de dados genômicos em vários nós de GPU.

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Mais de uma dúzia de fluxos de trabalho da Parabricks estão disponíveis no AWS HealthOmics, como fluxos de trabalho Ready2Run, que permitem aos clientes executar facilmente pipelines pré-criados.

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*Fonte: NVIDIA

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